El pasto azul de Kentucky ( L.) es una especie de césped altamente adaptada e importante en climas de estación fría. Tiene poliploidía alta y variable, cromosomas pequeños y metacéntricos, y un sistema de reproducción apomíctico facultativo. Como resultado de la poliploidía y la apomixis, identificar híbridos para la selección mendeliana, identificar progenies apomícticas fijas de hibridaciones deseables para el desarrollo de cultivares, o diferenciar entre cultivares con diferencias fenotípicas sutiles es un desafío sin la ayuda de marcadores moleculares. Aquí mostramos datos y revisamos investigaciones previas que muestran los usos y limitaciones de usar marcadores moleculares para la detección de híbridos, evaluación de apomixis y discriminación de cultivares. Para diferenciar entre diferentes offtipos apomícticos, son necesarios tanto marcadores moleculares como citometría de flujo. Para evaluar la similitud entre progenies de hibridaciones, así como para discriminar entre cultivares, se requieren conjuntos de marcadores y se debe considerar la variación molecular críptica. Plataformas de genotipado de alto rendimiento son críticas para aumentar la eficiencia de genotipado.