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Linearización del coalescente de Kingman

Autores: Slade, Paul F.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2018

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Acceso abierto

Artículo científico
2018

Linearización del coalescente de Kingman


Categoría

Matemáticas

Subcategoría

Matemáticas generales

Palabras clave

Modelo matemático
Genealogía
Proceso de coalescencia
Tamaño de la población
Probabilidades
Modelo Wright-Fisher

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 33

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El proceso de coalescencia de Kingman es un modelo matemático de genealogía en el que solo puede ocurrir un ancestro común de a pares. Los tiempos entre eventos sucesivos de coalescencia tienen una distribución exponencial negativa cuya tasa es igual al término combinatorio , donde denota el número de linajes presentes en la genealogía. Estas dos restricciones estándar del proceso de coalescencia de Kingman, obtenidas en el límite de un tamaño de población grande, aproximan el proceso ancestral exacto de los modelos de Wright-Fisher o Moran bajo una parametrización adecuada. El cálculo de las probabilidades de eventos de coalescencia con mayor precisión cuantifica la dependencia de los tamaños de muestra y población que se adhieren al proceso de coalescencia de Kingman. La convención de que las probabilidades de orden principal son despreciables siempre que se examina en etapas clave de la derivación matemática. Empíricamente, la paridad genealógica esperada del modelo haploide restringido de Wright-Fisher de un solo par supera el 99% donde ; de manera similar, por intervalo esperado donde . El criterio de raíz cúbica fraccional es practicable, ya que aunque corresponde a una paridad perfecta y en cierta medida confunde la identificabilidad, también se ajusta a probabilidades condicionales manejables de multi-coalescencia.

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