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Las proteínas b-box en: caracterización a nivel genómico y análisis de perfiles de expresión

Autores: Jin, Hanqi; Xing, Mengge; Cai, Chunmei; Li, Shuai

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2019

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Acceso abierto

Artículo científico
2019

Las proteínas b-box en: caracterización a nivel genómico y análisis de perfiles de expresión


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Proteínas
Crecimiento de plantas
Genes
Patrones de transcripción
Ubicaciones cromosómicas
Relaciones filogenéticas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 24

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las proteínas B-box (BBX) son factores importantes involucrados en el crecimiento y la regulación del desarrollo de las plantas, y han sido identificadas en muchas especies. Sin embargo, la información sobre las características y los patrones de transcripción de los genes en el maní silvestre es limitada. En este estudio, identificamos y caracterizamos 24 genes de un maní silvestre. Se analizaron muchas características, incluyendo ubicaciones cromosómicas, relaciones filogenéticas y estructuras génicas. Las proteínas B-box (AdBBX) se agruparon en cinco clases basadas en la diversidad de sus dominios conservados: I (3 genes), II (4 genes), III (4 genes), IV (9 genes) y V (4 genes). Se encontraron quince motivos distintos en las 24 proteínas AdBBX. El análisis de duplicación reveló la presencia de dos pares de genes duplicados intercromosómicos, de los grupos II y IV. Además, se encontraron 95 tipos de elementos cis-actuantes en las regiones promotoras de los genes, 53 de los cuales recibieron predicciones funcionales putativas. El número y los tipos de elementos cis-actuantes variaron entre diferentes promotores y, como resultado, los genes mostraron patrones de expresión distintos en diferentes tejidos. El perfil de transcripción combinado con el análisis de sintenia sugiere que puede ser un factor clave involucrado en la regulación del tiempo de floración. Nuestro estudio proporcionará información esencial para una posterior investigación funcional de los genes.

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