Limnoperna fortunei Dunker, 1857 es un bivalvo asiático invasor de agua dulce. Si bien es necesario contener su propagación, los estudios sobre la biología de las larvas son escasos. Correlacionamos los estadios larvarios de L. fortunei con factores bióticos como el fitoplancton y las principales variables abióticas en ambientes lóticos de la llanura aluvial del Alto Paraná. Las cuatro muestras se tomaron trimestralmente durante el año 2012. El análisis de componentes principales (ACP) mostró únicamente diferencias espaciales, al igual que el análisis de correspondencia canónica (ACC). Se registraron altas densidades de larvas en todas las muestras de los ríos Paraná y Bahía solo en diciembre, especialmente en las de etapa inicial. En cuanto al biovolumen de las algas, la clase Bacillarophyceae presentó el valor más alto, pero la clase Chlorophycea mostró una fuerte correlación con la densidad de larvas en etapa D. La gran variedad de fitoplancton, especialmente el microplancton Chlorophyceae, los altos valores de PO₄, NH₄ y la temperatura se correlacionaron positivamente con altas densidades de larvas en etapa D. Concluimos que la alta temperatura y la disponibilidad de alimento, indicadas por la comunidad fitoplanctónica, favorecieron la reproducción de L. fortunei y aumentaron la capacidad de dispersión de la especie debido al aumento en la emisión de propágulos. Por lo tanto, se deben realizar estudios que aborden la biología de las larvas del mejillón dorado para prevenir su propagación.