Los suelos son altamente sensibles al tipo de prácticas de labranza utilizadas, ya que estas prácticas influyen en las propiedades del suelo y afectan a los cultivos, al medio ambiente y a la sociedad. Sin embargo, no se ha informado sobre la investigación de la producción de yuca bajo diferentes sistemas de labranza durante condiciones de sequía en la Amazonía peruana. El objetivo de este estudio fue comparar las propiedades del suelo, la fisiología de la yuca y el rendimiento bajo prácticas de agricultura de conservación (AC) y agricultura tradicional (AT), con y sin mantillo, en un entorno escaso de agua. La humedad del suelo, la población de lombrices (Ew), la conductancia estomática, el índice de área foliar y el rendimiento comercial bajo AC fueron un 5,26% (~105,2 m ha), 83%, 1,2 veces, 1,14 veces y 7,3 t ha, respectivamente, más altos que bajo AT. La conductividad hidráulica (Ks) en AT fue 2,1 veces mayor que en AC. Sin embargo, Ks, la densidad aparente y Ew a lo largo del tiempo mostraron una recuperación gradual bajo AC. El factor de mantillo solo afectó a Ew, que fue mayor sin mantillo que con mantillo. Los resultados indican que las prácticas de AC fueron superiores a las prácticas de AT, mejorando las propiedades del suelo, la fisiología de la yuca y el rendimiento, y por lo tanto, ofrecen beneficios significativos en la conservación de recursos y una mayor producción y rentabilidad en un entorno propenso a la sequía.