Aunque el Pensamiento Lean (LT) se está volviendo popular en las organizaciones de servicios, pocos estudios han aplicado herramientas Lean al sector educativo. Además, aunque los inventarios son uno de los principales desperdicios en este sector, hasta la fecha, ningún estudio ha presentado un sistema de apoyo a la decisión (DSS), basado en LT, para la gestión de stock en instituciones académicas. Este estudio tiene como objetivo diseñar una aplicación de LT en laboratorios de enseñanza e investigación para proporcionar mejoras en la organización del lugar de trabajo, los tiempos de configuración y la gestión de stock. Se implementaron herramientas Lean en un estudio de caso, y se diseñó un DSS e-Kanban para determinar cuándo y en qué cantidad se debe realizar un pedido, considerando factores como la previsión de la demanda, el nivel de demanda (alto o bajo) y la deterioración de los componentes. Para probar el DSS, se llevó a cabo una simulación utilizando como ejemplo un conjunto de artículos que integran el protocolo de actividad del laboratorio. La implementación de herramientas Lean mejoró la organización del lugar de trabajo, lo que contribuyó a una reducción de movimientos innecesarios y del tiempo de configuración de las actividades prácticas. Además, el estudio demostró que el DSS desarrollado calcula las cantidades a pedir de acuerdo con las fórmulas matemáticas seleccionadas y genera alertas visuales apropiadas, dependiendo de la necesidad de realizar un pedido.