La zona hiporreica (ZH), como ecotono de conexión entre las aguas superficiales y subterráneas, forma parte funcional de los ecosistemas fluviales y subterráneos. Sus características hidrológicas, químicas, biológicas y metabólicas son específicas de esta zona, no perteneciendo propiamente ni a las aguas superficiales ni a las subterráneas. Los intercambios de agua, nutrientes y materia orgánica se producen en respuesta a las variaciones en el caudal, la topografía y la porosidad del lecho. Existen gradientes dinámicos a todas las escalas y varían temporalmente. En todas las escalas, la importancia funcional de la ZH se relaciona con su actividad y su conexión con la corriente superficial. La ZH es un entorno relativamente rico y casi todos los grupos de invertebrados han colonizado este hábitat. Esta fauna, denominada hiporrea, está compuesta por especies típicas del entorno intersticial, así como por especies bentónicas epigeas y freáticas. La microbiocenosis hiporreica está compuesta por bacterias, arqueas, protozoos y hongos. La HZ proporciona diversos servicios ecosistémicos y desempeña un papel fundamental en la mediación de los procesos de intercambio, tanto de materia como de energía, entre ecosistemas superficiales y subterráneos, actuando como reguladora del flujo hídrico, refugio de invertebrados bentónicos y lugar de almacenamiento, fuente y transformación de materia orgánica. La zona hiporreica es uno de los ambientes acuáticos más amenazados, fuertemente influenciado por las actividades humanas y el menos protegido por la legislación a nivel mundial. Su mantenimiento y conservación son cruciales para preservar la interconectividad ecológica entre las tres dimensiones espaciales del medio acuático. Si bien varios investigadores abordaron la importancia de la zona hiporreica tempranamente, y la mayoría de los modelos contemporáneos de ecosistemas fluviales la incluyen explícitamente, se sabe muy poco sobre la HZ de las regiones neotropicales. Desde un punto de vista biológico, la fauna hiporreica en las regiones neotropicales aún está subestimada en gran medida. Esta revisión se centra en una breve presentación de la zona hiporreica y sus funciones e importancia como ecotono. También se destacan los aspectos clave considerando el estado actual de la investigación en las regiones neotropicales.