Los patógenos y plagas adaptados amenazan seriamente la producción global de trigo. Durante las infecciones de patógenos y plagas, se explotan genes de trigo para apoyar la compatibilidad del trigo con los patógenos y plagas. Recientemente se identificó una gran cantidad de genes de trigo que regulan múltiples procesos, incluyendo la penetración (pre)patógena, la inmunidad de la planta, el sustento del patógeno y la alimentación de la plaga. La inactivación de algunos genes a través de técnicas de edición genómica y TILLING recientemente desarrolladas podría reducir la compatibilidad y conferir resistencia de amplio espectro y duradera, lo que proporciona un nuevo enfoque para mejorar la resistencia del trigo. En esta revisión, resumimos los avances recientes en la caracterización de los genes de trigo y destacamos sus roles multifacéticos en facilitar las interacciones compatibles del trigo con patógenos y plagas adaptados. Se discuten las estrategias actuales, limitaciones y futuras direcciones en la explotación de genes en la cría de trigo resistente.