Los complejos procesos evolutivos, como la selección positiva y la introgresión, pueden ser caracterizados por una evaluación profunda de la variación de secuencias a escala genómica completa. Aquí, demostramos los efectos combinados de la selección positiva y la introgresión adaptativa en los genomas, lo que resulta en la observación de puntos calientes de haplotipos de carreras de homocigosidad (ROH) en el genoma bovino moderno. Primero confirmamos que estos haplotipos observados en puntos calientes de ROH son resultados de la selección positiva. Los haplotipos bajo selección, incluyendo genes de interés biológico, como y , se sabe que están asociados con rasgos productivos en razas de ganado modernas. Entre los haplotipos bajo selección, demostramos que el haplotipo bajo selección estaba asociado con la producción de leche, un rasgo bajo una fuerte selección reciente, demostrando una causa probable de la barrida selectiva. Además, deducimos que la selección en haplotipos que contienen variantes que afectan el color del pelaje ocurrió aproximadamente hace 250 generaciones. El estudio sobre las genealogías y filogenias de estos haplotipos identifica que los eventos de introgresión de los haplotipos y ocurrieron desde hasta . Con la ayuda de datos de secuenciación y análisis evolutivos, aquí informamos eventos de introgresión en la formación del genoma bovino actual.