La enfermedad de Bakanae es principalmente causada por un hongo y es una enfermedad fúngica significativa con una serie de consecuencias desastrosas. Causa grandes pérdidas en la producción de arroz. Sin embargo, pocos estudios se han centrado en los detalles de la resistencia a la enfermedad de Bakanae en el arroz. Aquí, resumimos y discutimos el progreso de la resistencia a la enfermedad de Bakanae en el arroz. Además de la selección de germoplasma de arroz y la exploración de genes/loci de rasgos cuantitativos (QTL) relacionados con la resistencia, se determinó la ruta de invasión del patógeno en las plantas de arroz. También discutimos la regulación de genes relacionados con fitohormonas y los cambios en fitohormonas endógenas en las plantas de arroz inducidos por el patógeno. Para lograr un mejor control de la enfermedad de Bakanae, se evaluó el uso de fungicidas naturales en esta revisión. Durante las interacciones del arroz, los procesos de infección y la distribución espacial en plántulas y plantas adultas infectadas muestran tendencias diferentes. El crecimiento fúngico normalmente ocurre tanto en cultivares resistentes como en susceptibles, con menos abundancia en los primeros. Generalmente, la enfermedad de Bakanae es transmitida por semilla, y la desinfección de semillas mediante fungicidas efectivos siempre debe ser la primera y principal opción para controlar mejor la enfermedad. Además de la medida amigable y efectiva de usar fungicidas naturales, la cría y utilización de cultivares de arroz resistentes también es un método de control efectivo. En cierto modo, los cultivares de arroz con baja calidad de grano, subespecies y algunos germoplasmas de arroz enano o semi-enano son más resistentes a la enfermedad de Bakanae. Aunque no se obtuvieron germoplasmas altamente resistentes, se localizaron 37 QTL, con casi la mitad de los QTL ubicados en el cromosoma 1. Usando métodos ómicos, los WRKYs y los MAPKs generalmente se encontraron regulados durante las interacciones del arroz. La regulación de ciertos genes relacionados con fitohormonas y cambios en algunas fitohormonas endógenas inducidos por el patógeno fueron claros, es decir, se inhibieron los genes relacionados con la giberelina y se reprimieron las giberelinas endógenas en genotipos resistentes, pero se observaron resultados opuestos en genotipos de arroz susceptibles. En general, explorar germoplasmas resistentes o genes/QTL relacionados con la resistencia para la cría de arroz con resistencia a la enfermedad de Bakanae, ampliar la investigación sobre el mecanismo complejo de las interacciones del arroz y utilizar métodos de control innovadores, rentables y respetuosos con el medio ambiente contra la enfermedad son necesarios para la gestión presente y futura de la enfermedad de Bakanae.