Las áreas protegidas desempeñan roles significativos en la protección de la biodiversidad al mitigar las actividades humanas. Como un indicador de las actividades humanas, la huella humana (HF) se puede utilizar para evaluar la efectividad de las áreas protegidas. Desarrollamos un conjunto de datos de HF para la región de Sanjiangyuan en China después de localizar el modelo global de HF. Luego lo utilizamos para evaluar la efectividad de la reserva natural de Sanjiangyuan (SNR) en la mitigación de las presiones humanas. Nuestros resultados sugieren que el valor de HF para la región de Sanjiangyuan fue generalmente bajo de 1995 a 2015, con una tendencia fluctuante en aumento. La SNR es parcialmente efectiva en la mitigación de las presiones humanas. Para 2005-2010, los valores de HF disminuyeron tanto dentro como fuera de la reserva, con mayores disminuciones en el exterior. Para las tres zonas funcionales de la SNR, nuestros resultados muestran que los valores de HF disminuyeron durante 2005-2010 para todas ellas, con la mayor disminución en el área experimental, y aumentaron durante 2010-2015, con el menor aumento en las áreas centrales. Los resultados que obtuvimos son consistentes con las evaluaciones basadas en indicadores ecológicos. Es un desafío para el gobierno equilibrar la conservación y el desarrollo al establecer el Parque Nacional de Sanjiangyuan.