logo móvil
Contáctanos

La resecuenciación de genoma completo revela firmas de evolución adaptativa en y

Autores: Yang, Jingyu; Cai, Zizi; Fang, Yan; Shan, Binbin; Zhang, Ran; Lin, Longshan; Li, Yuan; Zhang, Jing

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

Descargar PDF

Acceso abierto

Artículo científico
2024

La resecuenciación de genoma completo revela firmas de evolución adaptativa en y


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Especies marinas
China
Resecuenciación del genoma completo
Loci SNP
Evolución adaptativa
Variación genómica

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
y son especies marinas de importancia económica a lo largo de la costa de China, con características morfológicas externas y hábitos de vida similares, con amplia distribución y fuerte adaptabilidad. Para investigar los mecanismos moleculares subyacentes a la evolución adaptativa de estas dos especies, realizamos una resecuenciación de genoma completo de 10 individuos de ambas especies de las aguas costeras de la isla Wuyu, Fujian, China, utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento. Obtuvimos información sobre variaciones SNP, InDel, CNV y SV y anotamos estas variaciones, construyendo una base de datos de variación genómica para ambas especies. Al comparar los datos de resecuenciación con genomas de referencia, identificamos 9,829,511 loci SNP en la población de y 34,051,056 loci SNP en la población de . Utilizando datos SNP de genoma completo, empleamos métodos Fst y ROD para identificar regiones genómicas candidatas bajo selección. La anotación funcional y el análisis de enriquecimiento utilizando bases de datos GO y KEGG revelaron una posible evolución adaptativa en asociada con la respuesta inmune, la alimentación, el crecimiento y desarrollo, y la locomoción, mientras que mostró una posible evolución adaptativa asociada con la respuesta inmune, el sistema nervioso, el crecimiento y desarrollo, y el metabolismo.

Otros recursos que podrían interesarte

Temas Virtualpro