La Primera Caracterización Genética del Gen en Patos Pekín ()
Autores: Nguyen, Thi-Thuy-Duong; Zayed, Mohammed; Kim, Yong-Chan; Jeong, Byung-Hoon
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La Primera Caracterización Genética del Gen en Patos Pekín ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Enfermedades priónicas
Proteína priónica mal plegada
Sombra de la proteína priónica
Polimorfismos genéticos
Secuencia de nucleótidos
Polimorfismos de un solo nucleótido
Licencia
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Consultas: 6
Citaciones: Sin citaciones
Las enfermedades priónicas son trastornos neurodegenerativos fatales caracterizados por una acumulación de proteína priónica mal plegada (PrP) en los tejidos cerebrales. La sombra de la proteína priónica (Sho) codificada por el gen de la sombra de la proteína priónica está involucrada en el progreso de la enfermedad priónica. La interacción entre Sho y PrP acelera la tasa de conversión de PrP, mientras que los polimorfismos genéticos se han asociado con la susceptibilidad a la enfermedad priónica en varias especies. Hasta ahora, el gen no ha sido investigado en patos. Identificamos la secuencia del gen del pato e investigamos los polimorfismos genéticos de 184 patos Pekín. Comparamos la secuencia de nucleótidos del pato y la secuencia de aminoácidos de la proteína Sho del pato con las de varias otras especies. Finalmente, predijimos la estructura de la proteína Sho del pato y los efectos de los polimorfismos de un solo nucleótido no sinónimos (SNPs) utilizando programas computacionales. Fuimos los primeros en informar sobre la secuencia del gen del pato Pekín. La secuencia de la proteína Sho del pato mostró un 100% de identidad en comparación con la secuencia de la proteína Sho del pollo. Encontramos 27 SNPs novedosos en el gen del pato. Se predijo que cuatro sustituciones de aminoácidos afectarían la distribución de enlaces de hidrógeno en la estructura de la proteína Sho del pato. Aunque MutPred2 y SNPs&GO predijeron que todos los polimorfismos no sinónimos eran neutros o benignos, SIFT predijo que cuatro variantes, A22T, G49D, A68T y M105I, eran perjudiciales. Hasta donde sabemos, este es el primer informe sobre las características genéticas y estructurales del gen del pato.
Descripción
Las enfermedades priónicas son trastornos neurodegenerativos fatales caracterizados por una acumulación de proteína priónica mal plegada (PrP) en los tejidos cerebrales. La sombra de la proteína priónica (Sho) codificada por el gen de la sombra de la proteína priónica está involucrada en el progreso de la enfermedad priónica. La interacción entre Sho y PrP acelera la tasa de conversión de PrP, mientras que los polimorfismos genéticos se han asociado con la susceptibilidad a la enfermedad priónica en varias especies. Hasta ahora, el gen no ha sido investigado en patos. Identificamos la secuencia del gen del pato e investigamos los polimorfismos genéticos de 184 patos Pekín. Comparamos la secuencia de nucleótidos del pato y la secuencia de aminoácidos de la proteína Sho del pato con las de varias otras especies. Finalmente, predijimos la estructura de la proteína Sho del pato y los efectos de los polimorfismos de un solo nucleótido no sinónimos (SNPs) utilizando programas computacionales. Fuimos los primeros en informar sobre la secuencia del gen del pato Pekín. La secuencia de la proteína Sho del pato mostró un 100% de identidad en comparación con la secuencia de la proteína Sho del pollo. Encontramos 27 SNPs novedosos en el gen del pato. Se predijo que cuatro sustituciones de aminoácidos afectarían la distribución de enlaces de hidrógeno en la estructura de la proteína Sho del pato. Aunque MutPred2 y SNPs&GO predijeron que todos los polimorfismos no sinónimos eran neutros o benignos, SIFT predijo que cuatro variantes, A22T, G49D, A68T y M105I, eran perjudiciales. Hasta donde sabemos, este es el primer informe sobre las características genéticas y estructurales del gen del pato.