La fragmentación forestal afecta la dinámica de las poblaciones animales, principalmente por la pérdida de hábitat y la interrupción de su movimiento. Las comunidades de lagartijas se ven afectadas por los cambios ambientales, pero, dependiendo de sus necesidades ecológicas, algunas especies podrían ser más vulnerables que otras. La Amazonia meridional sufre una aceleración de la acción antrópica que reemplaza los entornos naturales por tierras agrícolas (cultivos y pastizales). Esta región es considerablemente más seca que la mayor parte de la Amazonia septentrional, con bosques semicaducifolios estacionales fragmentados y aislados por pastizales y, en menor medida, por cultivos. Aquí presentamos datos sobre comunidades de lagartijas que utilizan bosques semicaducifolios, bordes de bosque y pastizales circundantes en la Amazonia meridional de Mato Grosso, Brasil. Se recolectaron lagartijas en 21 fragmentos de bosque (de 41 a 7035 ha) rodeados de pastizales, utilizando trampas de caída colocadas en un gradiente de degradación, desde el pastizal hacia el interior del fragmento de bosque (hasta 200 m). Recolectamos 242 individuos (14 especies, siete familias) en 6300 días de captura. El patrón de ocurrencia de las especies fue mayoritariamente anidado, y esta anidación se asoció con tres gremios de hábitat (generalista, tolerante a los bordes y forestal). Si bien no se observó un efecto de fragmentación evidente en la diversidad de lagartijas a nivel comunitario, Hoplocercus spinosus, Bachia dorbignyi, Microrblepharus maximiliani y Kentropyx calcarta fueron más vulnerables a dichos efectos que las otras diez especies recolectadas. Verificamos que los conjuntos que habitan pastizales y bordes de bosque son un subconjunto anidado de conjuntos provenientes del núcleo forestal. La vegetación nativa remanente no se distribuye de manera homogénea y las especies de lagartijas pueden persistir en diferentes partes del paisaje; por lo tanto, recomendamos la protección de los remanentes forestales como una importante medida de conservación para las lagartijas del sur de la Amazonía.