La identificación y análisis de expresión de la familia de genes
Autores: He, Shichan; Xu, Lin; Wu, Weihuang; Zhang, Jiaji; Hao, Zhaodong; Lu, Lu; Shi, Jisen; Chen, Jinhui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La identificación y análisis de expresión de la familia de genes
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de genes
Plantas
Desarrollo
Reproducción
Estrés abiótico
Regulación génica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes es una de las más grandes en las plantas y desempeña un papel crucial en la regulación del desarrollo vegetal, la reproducción, la degradación de proteínas celulares y la respuesta a estrés biótico y abiótico. A pesar de su importancia, no se ha reportado un análisis exhaustivo de la familia de genes en y otras especies de magnoliáceas. En este estudio, informamos por primera vez la identificación de 144 genes de longitud completa en . Basado en dominios específicos y análisis filogenéticos, estos genes se dividieron en 10 subfamilias distintas. Además, analizamos su estructura genética, dominio conservado y distribución cromosómica, eventos de replicación a nivel genómico y colinealidad. Adicionalmente, basado en el análisis de GO, encontramos que los genes exhiben especificidad funcional, con una proporción significativa de ellos involucrados en la unión de proteínas (GO:0005515), lo que sugiere que los genes pueden desempeñar un papel importante en la regulación genética en . Los datos de transcriptoma y los resultados de q-PCR también mostraron que los genes están involucrados en el desarrollo de múltiples tejidos en , regulan la embriogénesis somática de híbridos y juegan un papel fundamental en el estrés abiótico. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una base para entender la función biológica de los genes en y otras especies de plantas.
Descripción
La familia de genes es una de las más grandes en las plantas y desempeña un papel crucial en la regulación del desarrollo vegetal, la reproducción, la degradación de proteínas celulares y la respuesta a estrés biótico y abiótico. A pesar de su importancia, no se ha reportado un análisis exhaustivo de la familia de genes en y otras especies de magnoliáceas. En este estudio, informamos por primera vez la identificación de 144 genes de longitud completa en . Basado en dominios específicos y análisis filogenéticos, estos genes se dividieron en 10 subfamilias distintas. Además, analizamos su estructura genética, dominio conservado y distribución cromosómica, eventos de replicación a nivel genómico y colinealidad. Adicionalmente, basado en el análisis de GO, encontramos que los genes exhiben especificidad funcional, con una proporción significativa de ellos involucrados en la unión de proteínas (GO:0005515), lo que sugiere que los genes pueden desempeñar un papel importante en la regulación genética en . Los datos de transcriptoma y los resultados de q-PCR también mostraron que los genes están involucrados en el desarrollo de múltiples tejidos en , regulan la embriogénesis somática de híbridos y juegan un papel fundamental en el estrés abiótico. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una base para entender la función biológica de los genes en y otras especies de plantas.