La identificación del gen de modificación de ARN como un biomarcador potencial del cáncer de ovario
Autores: Li, Huimin; Chen, Lin; Han, Yunsong; Zhang, Fangfang; Wang, Yanyan; Han, Yali; Wang, Yange; Wang, Qiang; Guo, Xiangqian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
La identificación del gen de modificación de ARN como un biomarcador potencial del cáncer de ovario
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Modificaciones de ARN
Rmg
Cáncer de ovario
Sintetasa de pseudouridina 7
Biomarcador diagnóstico
Análisis roc
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
Las modificaciones de ARN son reversibles, reguladas dinámicamente y están involucradas en una variedad de enfermedades como el cáncer. Dada la falta de biomarcadores eficientes y confiables para el diagnóstico temprano del cáncer de ovario (OV), este estudio fue diseñado para explorar el papel de los genes de modificación de ARN (RMGs) en el diagnóstico de OV. En este sentido, se recuperaron 132 RMGs en PubMed, se obtuvieron 638 muestras de OV y 18 muestras de ovario normal en el Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA), y se recopilaron cohortes de GSE18520 para análisis diferencial. Finalmente, la (Pseudouridina Sintasa 7) como RMGs expresados diferencialmente (DEGs-RMGs) fue identificada como un candidato a biomarcador diagnóstico y evaluada por su especificidad y sensibilidad utilizando análisis de Característica Operativa del Receptor (ROC) en datos de TCGA y GEO. La expresión de proteínas, mutaciones, redes de interacción de proteínas, genes correlacionados, vías relacionadas, procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares también fueron analizados. La sobreexpresión de la proteína PUS7 en OV fue confirmada por las imágenes de tinción en HPA y arreglos de tejido. En conjunto, los hallazgos del presente estudio apuntan al potencial de PUS7 como un marcador diagnóstico y objetivo terapéutico para el cáncer de ovario.
Descripción
Las modificaciones de ARN son reversibles, reguladas dinámicamente y están involucradas en una variedad de enfermedades como el cáncer. Dada la falta de biomarcadores eficientes y confiables para el diagnóstico temprano del cáncer de ovario (OV), este estudio fue diseñado para explorar el papel de los genes de modificación de ARN (RMGs) en el diagnóstico de OV. En este sentido, se recuperaron 132 RMGs en PubMed, se obtuvieron 638 muestras de OV y 18 muestras de ovario normal en el Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA), y se recopilaron cohortes de GSE18520 para análisis diferencial. Finalmente, la (Pseudouridina Sintasa 7) como RMGs expresados diferencialmente (DEGs-RMGs) fue identificada como un candidato a biomarcador diagnóstico y evaluada por su especificidad y sensibilidad utilizando análisis de Característica Operativa del Receptor (ROC) en datos de TCGA y GEO. La expresión de proteínas, mutaciones, redes de interacción de proteínas, genes correlacionados, vías relacionadas, procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares también fueron analizados. La sobreexpresión de la proteína PUS7 en OV fue confirmada por las imágenes de tinción en HPA y arreglos de tejido. En conjunto, los hallazgos del presente estudio apuntan al potencial de PUS7 como un marcador diagnóstico y objetivo terapéutico para el cáncer de ovario.