La creciente frecuencia e intensidad de eventos de bajas temperaturas en ambientes acuáticos se ha convertido en una limitación crítica para la acuicultura sostenible de camarones, lo que a menudo conduce a pérdidas económicas sustanciales debido a un crecimiento reducido, funciones fisiológicas deterioradas y tasas de mortalidad elevadas en las poblaciones cultivadas. En este estudio, investigamos el patrón de expresión de HSP90 bajo estrés por bajas temperaturas. Además, se analizaron las alteraciones en los niveles de expresión de genes asociados con la vía de apoptosis mitocondrial después de la silenciamiento mediado por interferencia de ARN (RNAi) de MjHSP90 para confirmar su papel en el estrés por bajas temperaturas. Demostramos que la proteína de choque térmico 90 desempeña un papel importante en la tolerancia a bajas temperaturas, lo que mejora la tolerancia del organismo a bajas temperaturas al reducir la apoptosis inducida por bajas temperaturas. Este hallazgo sentó una base teórica para la cría de una nueva variedad tolerante a bajas temperaturas y el análisis del mecanismo de resistencia al frío de los crustáceos.