La evolución cromosómica de los retrotransposones Ty1 en ha sido revelada por FISH
Autores: Yu, Zehuai; Huang, Yongji; Wu, Jiayun; Zhang, Muqing; Deng, Zuhu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
La evolución cromosómica de los retrotransposones Ty1 en ha sido revelada por FISH
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Especies
Producción de biocombustibles
Retrotransposones
árbol filogenético
Distribución cromosómica
Evolución
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
es una especie potencial para la producción de biocombustibles. La caracterización y distribución cromosómica de retrotransposones podrían mejorar la comprensión del papel y la dinámica de los elementos repetitivos en las plantas. En este estudio, se construyó un árbol filogenético según las secuencias conservadas de la transcriptasa inversa y se reveló que estos retrotransposones Ty1- tenían una estructura típica. El análisis mostró que los retrotransposones totales Ty1- tenían un componente significativo, tan alto como 5.12 x 10 copias en . Luego, el patrón cromosómico de cuatro linajes conocidos también se analizó con el genoma, lo que sugirió que el linaje Sire/Maximus tenía el mayor número de copias seguido por Tork/Angela, Tork/TAR, Retrofit/Ale. Además, la distribución cromosómica de los retrotransposones totales Ty1- fue detectada mediante hibridación in situ fluorescente (FISH) como un patrón disperso con agrupamientos débiles, principalmente cerca de las regiones centroméricas de los cromosomas; interesantemente, hubo cuatro señales obvias en los cromosomas subterminales. Estos resultados sugirieron que ocurrieron direcciones de evolución dinámica diferencial de los retrotransposones Ty1- dentro de . Además, la co-localización de Ty1-, 5S rDNA y 35S rDNA indicó que se identificaron dos cromosomas 2 y cuatro cromosomas 4. Concurrentemente, las señales subterminales de los retrotransposones de tipo Ty1- se ubicaron en otros cuatro cromosomas homólogos. En conjunto, estos resultados arrojan luz sobre la diversificación de los retrotransposones Ty1- y tienen importancia para la generación de marcadores cromosómicos válidos en familias de retrotransposones.
Descripción
es una especie potencial para la producción de biocombustibles. La caracterización y distribución cromosómica de retrotransposones podrían mejorar la comprensión del papel y la dinámica de los elementos repetitivos en las plantas. En este estudio, se construyó un árbol filogenético según las secuencias conservadas de la transcriptasa inversa y se reveló que estos retrotransposones Ty1- tenían una estructura típica. El análisis mostró que los retrotransposones totales Ty1- tenían un componente significativo, tan alto como 5.12 x 10 copias en . Luego, el patrón cromosómico de cuatro linajes conocidos también se analizó con el genoma, lo que sugirió que el linaje Sire/Maximus tenía el mayor número de copias seguido por Tork/Angela, Tork/TAR, Retrofit/Ale. Además, la distribución cromosómica de los retrotransposones totales Ty1- fue detectada mediante hibridación in situ fluorescente (FISH) como un patrón disperso con agrupamientos débiles, principalmente cerca de las regiones centroméricas de los cromosomas; interesantemente, hubo cuatro señales obvias en los cromosomas subterminales. Estos resultados sugirieron que ocurrieron direcciones de evolución dinámica diferencial de los retrotransposones Ty1- dentro de . Además, la co-localización de Ty1-, 5S rDNA y 35S rDNA indicó que se identificaron dos cromosomas 2 y cuatro cromosomas 4. Concurrentemente, las señales subterminales de los retrotransposones de tipo Ty1- se ubicaron en otros cuatro cromosomas homólogos. En conjunto, estos resultados arrojan luz sobre la diversificación de los retrotransposones Ty1- y tienen importancia para la generación de marcadores cromosómicos válidos en familias de retrotransposones.