La vainilla es un cultivo económicamente importante para las regiones tropicales húmedas de baja altitud. La demanda mundial de vainilla natural está aumentando, pero las plantas cultivadas enfrentan graves problemas fitosanitarios. La enfermedad conocida como marchitez por Fusarium está principalmente relacionada con el hongo f. sp, y para su manejo, se debe entender la relación patógeno-hospedero. Cuatro accesiones de vainilla multiplicadas in vitro fueron evaluadas: dos de Colombia y México, una de y una (1) híbrido F1 (). Además, se evaluaron tres aislamientos de de diferentes plantas sintomáticas presentes en sistemas agroforestales a pequeña escala: (1Fov) f. sp. de hoja, (2Fov) f. sp. de raíz y (3Fs) también de raíz. Las plantas con dos meses de crecimiento fueron inoculadas in vitro por inmersión de raíces, y el desarrollo de la marchitez por Fusarium se registró durante 15 días, utilizando una escala de severidad para describir los síntomas y calcular el área bajo la curva de progreso de la enfermedad (AUDPC). No se encontraron diferencias estadísticas al analizar la interacción entre los aislamientos y las accesiones de vainilla. Sin embargo, al analizar independientemente el factor de diseño aislamientos, se encontraron diferencias significativas; el aislamiento 1Fov de f. sp. indujo los síntomas más graves, así como la muerte en algunas plantas de todas las accesiones, mientras que se consideró un patógeno secundario. No hubo diferencias estadísticas para el factor de accesiones de vainilla, pero los valores de AUDPC y los síntomas observados sugieren una ligera resistencia en todas las accesiones. Por lo tanto, se sugiere explorar el pool genético de la vainilla para generar material de multiplicación con genes de resistencia y contribuir con la mejora genética para integrar con éxito el manejo de la marchitez por Fusarium en sistemas comerciales.