La Divergencia Poblacional y la Base Genética de la Adaptación Local de la Soja Silvestre () en China
Autores: Liu, Xiaodong; Li, Peiyuan; Ding, Xiaoyang; Wang, Ying; Qi, Guangxun; Yu, Jiaxin; Zeng, Yong; Cai, Dezhi; Yang, Xuhang; Yang, Jiahui; Xu, Chunming; Liu, Bao; Dong, Yingshan; Zhao, Na
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La Divergencia Poblacional y la Base Genética de la Adaptación Local de la Soja Silvestre () en China
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Soja silvestre
Base genética
Divergencia poblacional
Adaptación local
Polimorfismos de un solo nucleótido a nivel del genoma
Aislamiento geográfico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
la especie silvestre relativa de la soja cultivada. En este estudio, investigamos la divergencia poblacional y la base genética de la adaptación local de la soja silvestre en China utilizando polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) a nivel del genoma de una población de 72 accesiones. Mediante análisis filogenético, observamos que las accesiones se agruparon en tres grupos distintos, cada uno correspondiente a una región geográfica específica: la región noreste (NER), la región central (CR) y la región sur (SR), lo que es consistente con estudios previos. Notablemente, encontramos una correlación positiva significativa entre las distancias genéticas y geográficas. Un análisis adicional de la estructura poblacional reveló que cada grupo estaba asociado con una población ancestral y un área geográfica específica. Al utilizar los datos de secuenciación del genoma de accesiones de 16 ubicaciones diferentes, inferimos la historia poblacional de estos grupos de soja silvestre. Nuestros resultados indican que los tres grupos divergieron hace aproximadamente 25,000 años, coincidiendo con el tiempo del último máximo glacial. El tamaño efectivo de la población del grupo SR se expandió primero, y posteriormente, los grupos NER y CR se expandieron hace aproximadamente 5000 y 2500 años, respectivamente. Además, se identificaron 83, 104 y 101 loci asociados significativos (SALs) utilizando análisis de asociación a nivel del genoma para la temperatura media anual, la precipitación anual y la latitud, respectivamente. El análisis funcional de los genes ubicados en los SALs destacó genes candidatos relacionados con la adaptación local. Este estudio resalta el papel significativo del aislamiento geográfico y los factores ambientales en la conformación de la estructura genética y la adaptabilidad de las poblaciones de soja silvestre. Además, enfatiza el valor de la soja silvestre como un recurso genético crucial para mejorar la adaptabilidad de las sojas cultivadas, que han experimentado una pérdida de diversidad genética debido a la domesticación y las prácticas de cría intensiva. Los conocimientos obtenidos de nuestra investigación proporcionan información valiosa para la protección, conservación y utilización de este importante recurso genético.
Descripción
la especie silvestre relativa de la soja cultivada. En este estudio, investigamos la divergencia poblacional y la base genética de la adaptación local de la soja silvestre en China utilizando polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) a nivel del genoma de una población de 72 accesiones. Mediante análisis filogenético, observamos que las accesiones se agruparon en tres grupos distintos, cada uno correspondiente a una región geográfica específica: la región noreste (NER), la región central (CR) y la región sur (SR), lo que es consistente con estudios previos. Notablemente, encontramos una correlación positiva significativa entre las distancias genéticas y geográficas. Un análisis adicional de la estructura poblacional reveló que cada grupo estaba asociado con una población ancestral y un área geográfica específica. Al utilizar los datos de secuenciación del genoma de accesiones de 16 ubicaciones diferentes, inferimos la historia poblacional de estos grupos de soja silvestre. Nuestros resultados indican que los tres grupos divergieron hace aproximadamente 25,000 años, coincidiendo con el tiempo del último máximo glacial. El tamaño efectivo de la población del grupo SR se expandió primero, y posteriormente, los grupos NER y CR se expandieron hace aproximadamente 5000 y 2500 años, respectivamente. Además, se identificaron 83, 104 y 101 loci asociados significativos (SALs) utilizando análisis de asociación a nivel del genoma para la temperatura media anual, la precipitación anual y la latitud, respectivamente. El análisis funcional de los genes ubicados en los SALs destacó genes candidatos relacionados con la adaptación local. Este estudio resalta el papel significativo del aislamiento geográfico y los factores ambientales en la conformación de la estructura genética y la adaptabilidad de las poblaciones de soja silvestre. Además, enfatiza el valor de la soja silvestre como un recurso genético crucial para mejorar la adaptabilidad de las sojas cultivadas, que han experimentado una pérdida de diversidad genética debido a la domesticación y las prácticas de cría intensiva. Los conocimientos obtenidos de nuestra investigación proporcionan información valiosa para la protección, conservación y utilización de este importante recurso genético.