Contrario a las suposiciones anteriores, la evidencia molecular ha demostrado la presencia de comunidades bacterianas del suelo diversas y localizadas en los Valles Secos de McMurdo en la Antártida. Mientras tanto, sigue sin estar claro si las señales fúngicas detectadas hasta ahora en los suelos de los Valles Secos mediante técnicas basadas en cultivos y moleculares representan biomasa adaptada y ecológicamente activa o esporas transportadas por el viento. A través de una encuesta molecular sistemática y cuantitativa, identificamos heterogeneidades significativas en las comunidades fúngicas del suelo a lo largo de los Valles Secos que se correlacionan robustamente con las heterogeneidades en las propiedades fisicoquímicas del suelo. El análisis de huellas comunitarias y la pirosecuenciación 454 de la región espaciadora intergénica ribosomal fúngica revelaron diferentes niveles de heterogeneidad en la diversidad fúngica dentro de los Valles Secos individuales y una sorprendente abundancia de especies de Chytridiomycota, mientras que estudios anteriores sugirieron que los suelos de los Valles Secos estaban dominados por Ascomycota y Basidiomycota. De manera crítica, identificamos diferencias significativas en la composición y estructura de la comunidad fúngica de sitios adyacentes sin una barrera obvia al transporte eólico entre ellos. Estos hallazgos sugieren que los hongos edáficos de los Valles Secos Antárticos están adaptados a los entornos locales y representan un componente heterotrófico ecológicamente relevante (y posiblemente importante) del ecosistema.