En este estudio, se compararon los subproteomas enriquecidos en pared celular a tres alturas diferentes de los tallos de alfalfa. Dado que estas tres alturas corresponden a diferentes estados en el desarrollo del tallo, se obtiene una visión sobre la dinámica del proteoma de la pared celular durante la maduración celular. Este estudio de fracciones enriquecidas en proteínas de la pared celular forma la base para una descripción del proceso de desarrollo de la pared celular y la vinculación de proteínas localizadas en la pared celular con la evolución de la composición y estructura de la pared celular. La extracción secuencial de proteínas de la pared celular con tampones complementados con CaCl, EGTA y LiCl se combinó con un enfoque proteómico basado en gel y análisis multivariado. Aunque se observaron las mayores similitudes entre las regiones apical e intermedia del tallo, los patrones del proteoma son característicos de cada región. Las proteínas que se unen a carbohidratos y tienen actividad proteolítica, así como las enzimas involucradas en la remobilización de glicanos, se acumulan en la región basal del tallo. La beta-amilasa y la ferritina también se acumulan más en el segmento basal del tallo. Por lo tanto, la remobilización de nutrientes parece ser un proceso importante en el segmento más antiguo del tallo. Las regiones intermedia y apical son sitios de remodelación del polímero de la pared celular, como sugiere la alta abundancia de proteínas involucradas en la remodelación de la pared celular, como la endoglucosilasa de xilano, la beta-galactosidasa o la subunidad no catalítica de la poligalacturonasa que contiene el dominio BURP. Sin embargo, el cambio más notable entre las diferentes partes del tallo es la fuerte acumulación de una proteína que contiene un dominio conservado DUF642 en la región apical del tallo, lo que sugiere un papel particular de esta proteína durante el desarrollo temprano de los tejidos del tallo.