La alelopatía es un mecanismo subyacente y controvertido para los efectos ambientales perjudiciales en la gestión de plantaciones. Sin embargo, se ha prestado poca atención a la dinámica de los aleloquímicos y la fitotoxicidad en la fauna del suelo durante la descomposición de la hojarasca. Para explorar la relación entre la dinámica de la fitotoxicidad y los aleloquímicos, se llevó a cabo un experimento de descomposición utilizando hojarasca de 4 y 8 años (0, 10, 20, 30 y 45 días). Se evaluó la toxicidad aguda y se realizó un análisis químico de las hojas de eucalipto. Se midieron marcadores bioquímicos, incluyendo proteína total, actividad de acetilcolinesterasa (AChE) y niveles de estrés oxidativo (SOD y MDA). Se utilizó un ensayo de cometas para determinar el daño en el ADN en las células. Los resultados mostraron que después de 20-30 días de descomposición, la hojarasca exhibió efectos fitotóxicos más fuertes en términos de crecimiento y niveles bioquímicos. Después de 20 días de descomposición, el peso y el contenido total de proteínas disminuyeron y luego aumentaron con el tiempo. La actividad de SOD aumentó después de 20 días, pero disminuyó después de 30 días de descomposición antes de aumentar nuevamente. El contenido de MDA aumentó después de 20 días, luego disminuyó o se mantuvo estable. La actividad de AChE fue inhibida después de 30 días de descomposición y luego aumentó o se estabilizó con una mayor descomposición. Los aleloquímicos solubles, como la betaína, el ácido clorogénico y el isoquercitrina, disminuyeron significativamente o desaparecieron durante la etapa inicial de descomposición, pero el ácido pipélico aumentó significativamente, junto con fracciones fenólicas recién emergentes que estaban presentes. Se liberaron más aleloquímicos de la hojarasca de 8 años que de la de 4 años, lo que resultó en respuestas fitotóxicas y daño en el ADN más severos de manera constante. Las medidas de gestión científica, como la eliminación adecuada de la hojarasca en las primeras etapas de descomposición, podrían ayudar a apoyar una mayor biodiversidad en las plantaciones.