Los pequeños ARN no codificantes (sRNAs) son factores regulatorios post-transcripcionales fundamentales que influyen en la actividad biológica. Estudios sobre la cepa patovar PXO99 del patógeno de la mancha bacteriana del arroz identificaron previamente un sRNA asociado a la virulencia, trans3287. Una cepa mutante que carecía de este sRNA, llamada SK01, resultó en una virulencia notablemente disminuida hacia el arroz. Este estudio tiene como objetivo esclarecer aún más la función virulenta bacteriana subyacente de trans3287. La expresión de trans3287 se cuantificó en condiciones nutricionales estándar e inductoras de virulencia para aclarar su mecanismo de producción. La detección de genes asociados a la virulencia reveló que trans3287 regulaba los procesos de síntesis de polisacáridos extracelulares, lipopolisacáridos y el sistema de secreción tipo III. Además, la predicción bioinformática y la PCR cuantitativa indicaron un posible objetivo directo de trans3287, que codifica la cardiolipina sintasa. Un sistema de doble plásmido fusionado con la etiqueta GFP y la inmunoblotting de proteínas confirmaron que el sRNA trans3287 regulaba negativamente. Los biofilms bacterianos demostraron que trans3287 regulaba la interrupción de la integridad del biofilm a través de la cardiolipina sintasa. Este estudio proporciona información preliminar sobre los fundamentos mecánicos del papel del sRNA trans3287 en la mediación de la virulencia bacteriana a través de la cardiolipina sintasa.