La pudrición de raíces común causada por infestaciones en el trigo es una de las principales razones de la reducción del rendimiento en los cultivos de trigo en todo el mundo. La cepa de bacteria JK-25 utilizada en la investigación actual fue aislada del suelo de la rizosfera del trigo y fue identificada posteriormente en función de sus propiedades morfológicas, fisiológicas, bioquímicas y moleculares. La cepa mostró un antagonismo significativo y la inhibición del peso seco del micelio y la tasa de germinación de esporas por el sobrenadante de fermentación de JK-25 alcanzó el 60% y el 88%, respectivamente. El extracto crudo de JK-25 fue encontrado, mediante espectrometría de masas por desorción/ionización láser asistida por matriz (MALDI-TOF-MS), que contenía surfactina que ejerció un efecto inhibitorio. La interrupción de las membranas celulares del micelio fue observada bajo un microscopio confocal de escaneo láser (LSCM) después del tratamiento del micelio con el extracto crudo. La actividad de la enzima antioxidante fue significativamente reducida y el contenido del producto de oxidación malondialdehído (MDA) aumentó después del tratamiento con el extracto crudo. La incidencia de la pudrición de raíces se redujo significativamente en experimentos en macetas con la adición del sobrenadante de fermentación de la cultura de JK-25, que tuvo un efecto de control biológico significativo del 72.06%. Su capacidad para producir sideróforos puede ayudar a promover el crecimiento del trigo y la producción de proteasas y pectinasa también puede ser parte del papel de la cepa en la supresión de patógenos. Estos resultados demuestran el excelente efecto antagonista de JK-25 y sugieren que esta cepa tiene un gran potencial como recurso para el control biológico de cepas de pudrición de raíces del trigo.