La preservación de los recursos hídricos está directamente relacionada con el monitoreo de la contaminación fecal, lo que permite el desarrollo de estrategias para la gestión de fuentes contaminantes. En el presente estudio, se utilizaron veinticinco muestras de agua de seis puntos de recolección de agua de abastecimiento público para evaluar la presencia de cafeína, coliformes totales y fecales. Se detectó cafeína en todas las muestras, con concentraciones que oscilaron entre 0,15 ng mL⁻¹ y 16,72 ng mL⁻¹. Se detectaron coliformes totales en todas las muestras, con concentraciones en el rango de 52 NMP/100 mL a más de 24 196 NMP/100 mL, independientemente de si el rango de concentración de coliformes fecales se encontraba entre menos de 1 NMP/100 mL y 7800 NMP/100 mL. No se encontró correlación significativa entre los coliformes totales y las concentraciones de cafeína (rs = 0,35, p = 0,09). Sin embargo, se encontró una correlación moderada entre los coliformes fecales y las concentraciones de cafeína (rs = 0,412, p <0,05), lo que probablemente indica una fuente humana de estas bacterias. La determinación de cafeína en el agua puede ser una estrategia útil para evaluar la contaminación del agua por desechos fecales humanos.