La neuroanatomía siempre es un tema desafiante para los estudiantes de veterinaria. Se acepta ampliamente que entender la anatomía del sistema nervioso central (SNC) es esencial para explicar muchos de los procesos patológicos que afectan al cerebro. Aunque su estudio ha variado a lo largo del tiempo para lograr este objetivo, en la medicina humana y veterinaria es difícil encontrar un método de enseñanza que asocie la anatomía normal con las alteraciones patológicas del cerebro. Por primera vez, hemos creado una herramienta educativa que combina neuroanatomía y neuropatología, utilizando diferentes imágenes de resonancia magnética (RM) como base y el software EspINA como analizador, para obtener estructuras segmentadas y reconstrucciones en 3D del cerebro del perro. Demostramos que esta combinación es una herramienta óptima para ayudar a los anatomistas a entender el encéfalo y, además, para ayudar a los clínicos a reconocer enfermedades que incluyen una multitud de problemas neurológicos. Además, hemos intentado ver si la fotogrametría, que es una técnica común en otras ciencias, por ejemplo, la geología, podría ser útil para enseñar neuroanatomía veterinaria. Aunque aún necesitamos más investigaciones, hemos podido generar reconstrucciones en 3D de todo el cerebro, con resultados muy prometedores hasta la fecha.