L6-AK89, un inoculante efectivo de variedades: cribado fenotípico y de genoma profundo
Autores: Roumiantseva, Marina L.; Vladimirova, Maria E.; Saksaganskaia, Alla S.; Muntyan, Victoria S.; Kozlova, Alexandra P.; Afonin, Alexey M.; Baturina, Olga A.; Simarov, Boris V.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
L6-AK89, un inoculante efectivo de variedades: cribado fenotípico y de genoma profundo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Papel
Genoma accesorio
Cepa L6-AK89
Simbionte
Tolerancia al estrés
Eficiencia simbiótica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 23
Citaciones: Sin citaciones
Este documento presenta un análisis profundo del genoma accesorio de una cepa económicamente prometedora de (), L6-AK89, obtenida como resultado de la secuenciación de alto rendimiento de próxima generación (MiSeq, MinIon). La cepa L6-AK89 es un mutante de la cepa nativa CIAM1775, un simbionte adaptado a un hábitat salino y árido en el noroeste de Kazajistán. CIAM1775 es un inoculante efectivo de cv. Mira (tipo forraje estándar), cultivado en suelos moderadamente ácidos en la región agrícola del noroeste de Rusia. La cepa L6-AK89 permite obtener aumentos esperados (>150%) en la masa seca de la misma variedad de planta en pruebas de plantas. El genoma L6-AK89 tiene una proporción aumentada de secuencias relacionadas con los elementos accesorios en comparación con la cepa de referencia Rm1021, 7.4% versus 4.8%. Se evaluaron un conjunto de 53 genes y 32 genes involucrados en la tolerancia al estrés junto con ARNr 16S y ----. La alta eficiencia simbiótica de L6-89 con trébol de lúpulo se debe muy probablemente a características únicas de su genoma, en combinación con diferencias estructurales en sus genes relacionados con el estrés, así como a grupos únicos de genes de percepción de quórum y síntesis de osmoprotectores.
Descripción
Este documento presenta un análisis profundo del genoma accesorio de una cepa económicamente prometedora de (), L6-AK89, obtenida como resultado de la secuenciación de alto rendimiento de próxima generación (MiSeq, MinIon). La cepa L6-AK89 es un mutante de la cepa nativa CIAM1775, un simbionte adaptado a un hábitat salino y árido en el noroeste de Kazajistán. CIAM1775 es un inoculante efectivo de cv. Mira (tipo forraje estándar), cultivado en suelos moderadamente ácidos en la región agrícola del noroeste de Rusia. La cepa L6-AK89 permite obtener aumentos esperados (>150%) en la masa seca de la misma variedad de planta en pruebas de plantas. El genoma L6-AK89 tiene una proporción aumentada de secuencias relacionadas con los elementos accesorios en comparación con la cepa de referencia Rm1021, 7.4% versus 4.8%. Se evaluaron un conjunto de 53 genes y 32 genes involucrados en la tolerancia al estrés junto con ARNr 16S y ----. La alta eficiencia simbiótica de L6-89 con trébol de lúpulo se debe muy probablemente a características únicas de su genoma, en combinación con diferencias estructurales en sus genes relacionados con el estrés, así como a grupos únicos de genes de percepción de quórum y síntesis de osmoprotectores.