En 2019, los residentes del distrito rural de San Rafael Comac en el municipio de San Andrés Cholula, México, impugnaron la implementación del Programa Municipal de Desarrollo Urbano Sostenible de San Andrés Cholula (MPSUD) de 2018, una política de planificación urbana rapaces que estaba afectando negativamente a las comunidades ancestrales-pueblos originarios-y sus tierras y tradiciones. En 2020, un instrumento legal llamado el juicio de amparo demostró ser efectivo al ordenar la derogación del MPSUD y exigir una consulta indígena, basándose en el argumento del auto-reconocimiento de la identidad local e indígena. Tal identidad les otorgaría los derechos territoriales específicos contenidos en la Constitución Mexicana y en tratados internacionales. Para explicar su identidad indígena en el juicio de amparo, se refirieron a un sistema de organización socio-espacial antiguo establecido que funcionaba más allá de las fronteras administrativas: el sistema altepetl mesoamericano. El altepetl, que consiste en la unión entre la tierra y el pueblo, se designa en el juicio de amparo como la base de su forma actual de organización socio-espacial. Este documento es una revisión de políticas de tierras del MPSUD y del juicio de amparo, con un enfoque de estudio de caso para San Rafael Comac, basado en una revisión de la literatura. La investigación concluye que la consulta indígena es una herramienta y acción clave para el empoderamiento hacia una gestión responsable de la tierra en un contexto donde el desarrollo urbano privado afecta los usos y costumbres tradicionales de la tierra, y podría ser beneficiosa para las comunidades tradicionales en México y otros países de América Latina.