Intraspecific variability and distribution difference within the ribosomal introns of the discrete group in Japan: a case study for complex dynamics of intron evolution
Autores: Lam, Anh Tung Phan; Sasaki, Kazunori; Yanagi, Yukiko; Tanaka, Shuhei; Ito, Shin-ichi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Intraspecific variability and distribution difference within the ribosomal introns of the discrete group in Japan: a case study for complex dynamics of intron evolution
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Intrones ribosómicos
Poblaciones
Maleza
Variación genética
Mutaciones
Patogénesis
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
El análisis de los intrones ribosomales de las poblaciones que infectan la maleza crucífera reveló la compleja dinámica de tamaño, variabilidad intraespecífica y distribución. Los resultados mostraron que las poblaciones de la maleza han perdido múltiples intrones en las subunidades pequeñas y grandes de los genes de ARN ribosomal. Además, los intrones retenidos, a pesar de compartir en gran medida partes conservadas con las cepas cosmopolitas, contenían numerosas estructuras novedosas. Estas diferencias estructurales comprenden un alto nivel de polimorfismos, como mutaciones puntuales de transversión que ocurren en sitios que involucran los sitios de empalme intrónicos o inserciones/deleciones en los sitios de unión. Dos poblaciones geográficas de (falta información) portaban un largo ORF codificado por un intrón y elementos móviles putativos establecidos en la subunidad grande. Algunas poblaciones de los cultivos también albergaban intrones polimórficos que compartían motivos mutados comunes con el grupo que afecta a la maleza. La diversidad de intrones ribosomales observada en esas poblaciones investigadas demostró la distinción genética de las poblaciones de (falta información). Las variaciones genéticas podrían desempeñar un papel clave en la adaptabilidad de las poblaciones que infectan la maleza y probablemente estén relacionadas con el proceso de patogénesis para las que infectan los cultivos cosmopolitas.
Descripción
El análisis de los intrones ribosomales de las poblaciones que infectan la maleza crucífera reveló la compleja dinámica de tamaño, variabilidad intraespecífica y distribución. Los resultados mostraron que las poblaciones de la maleza han perdido múltiples intrones en las subunidades pequeñas y grandes de los genes de ARN ribosomal. Además, los intrones retenidos, a pesar de compartir en gran medida partes conservadas con las cepas cosmopolitas, contenían numerosas estructuras novedosas. Estas diferencias estructurales comprenden un alto nivel de polimorfismos, como mutaciones puntuales de transversión que ocurren en sitios que involucran los sitios de empalme intrónicos o inserciones/deleciones en los sitios de unión. Dos poblaciones geográficas de (falta información) portaban un largo ORF codificado por un intrón y elementos móviles putativos establecidos en la subunidad grande. Algunas poblaciones de los cultivos también albergaban intrones polimórficos que compartían motivos mutados comunes con el grupo que afecta a la maleza. La diversidad de intrones ribosomales observada en esas poblaciones investigadas demostró la distinción genética de las poblaciones de (falta información). Las variaciones genéticas podrían desempeñar un papel clave en la adaptabilidad de las poblaciones que infectan la maleza y probablemente estén relacionadas con el proceso de patogénesis para las que infectan los cultivos cosmopolitas.