Este estudio utilizó isótopos estables de hidrógeno y oxígeno como trazadores naturales para investigar su composición isotópica en la precipitación y en aguas subterráneas superficiales y profundas en las Islas Penghu en el estrecho de Taiwán. Nuestro objetivo fue comprender las diferencias y relaciones en las composiciones isotópicas dentro de varios cuerpos de agua y evaluar la fuente de recarga de aguas subterráneas. Las composiciones isotópicas de hidrógeno y oxígeno de las aguas subterráneas muestreadas se distribuyen principalmente a lo largo de la línea de agua meteórica en las Islas Penghu, siendo las variaciones en el rango de distribución menores (los valores de D se distribuyen de -48.2 a -37.7, con un valor medio de -43.14 +/- 2.4; los valores de O se distribuyen de -6.96 a -5.46, con un valor medio de -6.34 +/- 0.34). Los datos sugieren que las aguas subterráneas provienen principalmente de la precipitación local. Además, una comparación de las composiciones isotópicas de hidrógeno y oxígeno de las aguas subterráneas y la precipitación en Taiwán muestra que los valores para las aguas subterráneas se distribuyen entre los de la precipitación durante la temporada del monzón del noreste y la del suroeste. Sin embargo, algunas tendencias de los valores se acercan a la composición isotópica de la precipitación durante la temporada del monzón del suroeste. Por lo tanto, la fuente de las aguas subterráneas puede tener una asociación más cercana con la precipitación durante este tiempo.