La construcción de sistemas regionales de innovación (SRI) se ha convertido en una medida importante para que China implemente una estrategia de desarrollo impulsada por la innovación, pero se necesita una forma moderadamente compleja de describir las características de los SRI para ayudar en la implementación de esta estrategia. Basado en el marco de sujeto-recurso-entorno (SRE) con cinco condiciones secundarias, este estudio toma 31 regiones en China como casos y estudia la capacidad de innovación de los SRI utilizando el enfoque de análisis comparativo cualitativo de conjuntos difusos (fsQCA). Los hallazgos son los siguientes: (1) Diferentes combinaciones de las cinco condiciones han generado dos configuraciones de alta y una de baja capacidad de innovación de los SRI. (2) Las dos configuraciones de alta capacidad de innovación son el tipo de inversión independiente y el tipo abierto independiente. (3) La configuración de baja capacidad de innovación es el tipo de deficiencia de recursos centrales. Este estudio ha simplificado la complejidad de los SRI hasta cierto punto y ha revelado que el efecto de coincidencia entre las condiciones centrales es clave para obtener una alta capacidad de innovación. Las conclusiones proporcionan implicaciones prácticas para que los SRI en China adquieran capacidades de innovación apropiadas según sus condiciones de dotación de recursos.