Este artículo tiene como objetivo promover el desarrollo de alta calidad del Gran Grupo de Ciudades Changsha-Zhuzhou-Xiangtan y mejorar la eficiencia de la innovación verde en la aglomeración urbana. Este artículo toma la innovación verde en aglomeraciones urbanas en red como su tema de investigación. Además, analiza el impacto de características de la estructura de la red, como la escala de la red y los agujeros en la estructura de la red, en la innovación verde en las aglomeraciones urbanas. Además, este estudio utiliza el modelo SBM de salida inesperada para medir la eficiencia de la innovación verde de las ocho ciudades a nivel de prefectura en el Gran Grupo de Ciudades Changsha-Zhuzhou-Xiangtan desde 2012 hasta 2018 y analiza sus factores influyentes utilizando el modelo Tobit de panel. Los resultados muestran que la eficiencia general de la innovación verde del Gran Grupo de Ciudades Changsha-Zhuzhou-Xiangtan es estable. La distribución de la eficiencia de la innovación verde urbana en la región se caracteriza por un gradiente urbano y un impulso de corriente media. En el proceso de innovación en red, el desarrollo económico, que tiene un impacto positivo en la innovación verde, promueve la efectividad general de la estructura de la red. La baja eficiencia de los recursos educativos urbanos, que tiene un impacto negativo en la innovación verde, conduce a la redundancia de la escala de la red. La ventaja poco evidente de las estructuras industriales, que tiene un impacto negativo en el desarrollo de la innovación verde, conduce a la insuficiencia en la profundidad y amplitud de la apertura de la red. Por último, el apoyo gubernamental y el nivel de infraestructura no tienen impacto en la innovación verde.