Dentro de los objetivos de la acuicultura moderna, el presente estudio tuvo como objetivo combinar la formulación de piensos acuáticos sostenibles y los sistemas de cultivo. Se probaron dos dietas experimentales caracterizadas por un 3% y un 20% de reemplazo de harina de pescado con harina de prepupas de mosca soldado negra enriquecida con espirulina (HPM3 y HPM20, respectivamente) en juveniles de lubina europea durante un ensayo de alimentación de 90 días realizado en sistemas acuapónicos. Las dietas experimentales aseguraron un 100% de supervivencia y un rendimiento zootécnico adecuado. No se evidenciaron alteraciones conductuales en los peces. Los análisis histológicos y moleculares no revelaron alteraciones estructurales ni signos de inflamación a nivel intestinal, destacando el papel beneficioso de las moléculas bioactivas típicas de HPM o derivadas del procedimiento de enriquecimiento del sustrato de crecimiento de los insectos con espirulina en la salud intestinal. Considerando las características de calidad, las dietas experimentales probadas no alteraron negativamente el perfil de ácidos grasos del filete y no comprometieron las características físicas del filete. Además, los resultados destacaron un posible papel de HPM enriquecido con espirulina en la preservación del filete de la oxidación lipídica. En conjunto, estos resultados corroboran el uso de ingredientes sostenibles (HPM enriquecido con espirulina) en sistemas acuapónicos para la cría de peces eurihalinos.