Los microorganismos permanecen en el agua de diversas fuentes después de la desalinización y otros tratamientos, lo que representa riesgos para la salud. Exploramos agentes de desinfección natural alternativos, centrándonos en el extracto de semilla de uva (ESU). Recogimos semillas de uva locales en Arabia Saudita y analizamos sus componentes químicos. Utilizando cromatografía de gases-espectrometría de masas y espectrometría de masas con plasma acoplado inductivamente, identificamos fitocompuestos esenciales en el ESU, incluidos polifenoles, flavonoides y alcaloides. Notablemente, el ESU estaba libre de bacterias y contaminación por metales pesados y era rico en metales nutrientes beneficiosos. Realizamos análisis cualitativos en muestras de agua y orina locales para detectar infecciones bacterianas, metales pesados y minerales. Para evaluar el potencial antibacteriano del ESU, realizamos un análisis de acoplamiento molecular. Nuestros resultados revelan una fuerte energía de unión entre el ESU y los receptores de proteínas bacterianas, similar a la de los antibióticos estándar. Además, los resultados de las investigaciones piloto de laboratorio se alinean con los de los análisis computacionales, confirmando la eficacia del ESU. Las pruebas de difusión en agar mostraron zonas de inhibición significativamente mayores para el extracto de aceite crudo en comparación con el ESU diluido y el control positivo contra las bacterias detectadas en las muestras de agua y orina. Además, identificamos contaminación por cuatro cepas bacterianas y metales pesados en muestras de agua y orina femenina, destacando la necesidad de desinfectantes de agua efectivos. El ESU muestra promesas como un desinfectante natural de agua seguro y potente.