Una notable diversidad morfológica y variabilidad de cariotipos se puede observar en el género de peces gato acorazados neotropicales. Estos peces ofrecen un modelo útil para explorar tanto la evolución de los cariotipos como de los cromosomas sexuales, ya que muchas especies poseen sistemas de cromosomas sexuales heterogaméticos masculinos y una alta tasa de reestructuración del cariotipo. Basándonos en la organización del cariotipo, la distribución cromosómica de varias clases de ADN repetitivo y las estimaciones aproximadas de divergencias genómicas a niveles intraespecíficos e interespecíficos a través de la Hibridación Genómica Comparativa, identificamos números de cromosomas diploides compartidos (2n = 54) pero diferentes composiciones de cariotipo en (20m + 26sm + 8a) y sp. 3 (16m + 18sm + 14st + 6a), y diferentes 2n en (2n = 58; 20m + 26sm + 2st + 10a). Todas las especies mostraron además patrones similares de distribución cromosómica en relación con la heterocromatina constitutiva, los sitios de ADN ribosómico 18S (rDNA) y la mayoría de los motivos de microsatélites analizados. Además, se identificaron diferencias en la distribución de los sitios de rDNA 5S y un subconjunto de secuencias de microsatélites. Los cromosomas sexuales heteromórficos estaban ausentes en y en la escala de nuestro análisis. Sin embargo, un único par de cromosomas en machos de sp. 3 presentó una notable acumulación de sondas derivadas del genoma masculino después de la CGH, apuntando a una región tentativa de diferenciación temprana de cromosomas sexuales. Así, nuestros datos respaldan la evidencia previamente delineada de que es un modelo vital para la investigación de la dinámica del cariotipo y los cromosomas sexuales de los teleósteos.