El citral, un compuesto orgánico encontrado en el aceite de hierba de limón y en aceites esenciales, ha demostrado tener una notable actividad antifúngica contra el patógeno del tizón del arroz, que causa pérdidas económicas significativas en la producción de arroz. Sin embargo, el papel del citral en la inducción de estrés oxidativo relacionado con la capacidad antifúngica y sus redes regulatorias subyacentes siguen siendo poco claros. En este estudio, investigamos los efectos oxidativos del citral y realizamos análisis transcriptómicos y metabolómicos ampliamente dirigidos (WTM) en los micelios. Los resultados mostraron que el citral inducía actividades de superóxido dismutasa (SOD), catalasa (CAT) y ascorbato peroxidasa (APX), pero reducía la actividad de glutatión S-transferasa (GST) con una concentración máxima efectiva (EC) del 25% y del 75%. Importante, el citral a EC redujo las actividades del complejo I de la cadena respiratoria mitocondrial, el complejo III y el contenido de ATP, mientras que aumentó la actividad del complejo II de la cadena respiratoria mitocondrial. Además, el citral provocó un aumento de especies reactivas de oxígeno (ROS) y una pérdida del potencial de membrana mitocondrial (MMP) a través de la observación de fluorescencia. Además, el análisis de RNA-seq y el análisis metabolómico identificaron un total de 466 genes diferencialmente expresados (DEGs) y 32 metabolitos diferenciales (DAMs) después de que los micelios fueron tratados con citral. El siguiente análisis multi-óptico reveló que las vías metabólicas centradas en AsA, GSH y melatonina fueron claramente suprimidas por el citral, indicando un equilibrio redox perturbado en la célula. Estos hallazgos proporcionan más evidencias que respaldan la actividad antifúngica del citral y ofrecen nuevas perspectivas sobre la respuesta de las células al estrés oxidativo inducido por el citral.