Explorando la familia de genes del factor de transcripción de choque térmico () en el jengibre: una investigación a nivel genómico sobre la evolución, el perfil de expresión y la respuesta a estrés de desarrollo y abiótico
Autores: Jiang, Dongzhu; Xia, Maoqin; Xing, Haitao; Gong, Min; Jiang, Yajun; Liu, Huanfang; Li, Hong-Lei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Explorando la familia de genes del factor de transcripción de choque térmico () en el jengibre: una investigación a nivel genómico sobre la evolución, el perfil de expresión y la respuesta a estrés de desarrollo y abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Jengibre
Estrés abiótico
Factores de transcripción de choque térmico
Familia de genes
Estructura genética
Respuesta al estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
El jengibre es un cultivo valioso conocido por sus beneficios nutricionales, de condimento y de salud. Sin embargo, los estreses abióticos, como las altas temperaturas y la sequía, pueden afectar negativamente su crecimiento y desarrollo. Los factores de transcripción de choque térmico han sido reconocidos como elementos cruciales para mejorar la resistencia al calor y a la sequía en las plantas. No obstante, ningún estudio previo ha investigado la familia de genes en el jengibre. En esta investigación, se identificaron un total de 25 miembros en el genoma del jengibre, que estaban distribuidos de manera desigual en diez cromosomas. Los miembros se dividieron en tres grupos (HSFA, HSFB y HSFC) según su estructura genética, motivos de proteínas y relaciones filogenéticas con Arabidopsis. Curiosamente, encontramos más pares de genes colineales entre genes de monocotiledóneas, como el arroz, el trigo y el plátano, que entre dicotiledóneas. Además, identificamos 12 genes que probablemente surgieron de eventos de duplicación. El análisis de promotores reveló que los elementos de respuesta hormonal (respuesta a MEJA y respuesta al ácido abscísico) eran dominantes entre los diversos elementos cis relacionados con la respuesta al estrés abiótico en los promotores. El análisis del patrón de expresión confirmó la expresión diferencial de los miembros en diferentes tejidos, siendo la mayoría sensibles al estrés por calor y sequía. Este estudio sienta las bases para futuras investigaciones sobre el papel funcional de la regulación de las respuestas al estrés abiótico en el jengibre.
Descripción
El jengibre es un cultivo valioso conocido por sus beneficios nutricionales, de condimento y de salud. Sin embargo, los estreses abióticos, como las altas temperaturas y la sequía, pueden afectar negativamente su crecimiento y desarrollo. Los factores de transcripción de choque térmico han sido reconocidos como elementos cruciales para mejorar la resistencia al calor y a la sequía en las plantas. No obstante, ningún estudio previo ha investigado la familia de genes en el jengibre. En esta investigación, se identificaron un total de 25 miembros en el genoma del jengibre, que estaban distribuidos de manera desigual en diez cromosomas. Los miembros se dividieron en tres grupos (HSFA, HSFB y HSFC) según su estructura genética, motivos de proteínas y relaciones filogenéticas con Arabidopsis. Curiosamente, encontramos más pares de genes colineales entre genes de monocotiledóneas, como el arroz, el trigo y el plátano, que entre dicotiledóneas. Además, identificamos 12 genes que probablemente surgieron de eventos de duplicación. El análisis de promotores reveló que los elementos de respuesta hormonal (respuesta a MEJA y respuesta al ácido abscísico) eran dominantes entre los diversos elementos cis relacionados con la respuesta al estrés abiótico en los promotores. El análisis del patrón de expresión confirmó la expresión diferencial de los miembros en diferentes tejidos, siendo la mayoría sensibles al estrés por calor y sequía. Este estudio sienta las bases para futuras investigaciones sobre el papel funcional de la regulación de las respuestas al estrés abiótico en el jengibre.