El frijol yam (Rich. Ex DC.) es un cultivo leguminoso subutilizado que ha sido utilizado como fuente de alimento en América Central y Asia. Está adaptado a una variedad de entornos y está estrechamente relacionado con importantes cultivos alimenticios leguminosos, ofreciendo el potencial para comprender la base genética de la adaptación ambiental, y puede ser utilizado como fuente de nuevos genes y alelos para la mejora de otras leguminosas. Aquí, ensamblamos un genoma preliminar de 460 Mbp de tamaño que contiene 37,886 modelos de genes. Utilizamos este ensamblaje para comparar tres cultivares de yam bean y los relacionados estrechamente, identificando 10,187,899 polimorfismos de nucleótido único (SNPs) candidatos. La distribución de SNPs refleja el origen geográfico y la morfología de los individuos.