La germinación de semillas es un proceso complejo que puede verse afectado negativamente por numerosos estreses. spp. son conocidos como agentes de biocontrol efectivos, así como estimuladores del crecimiento y la germinación de plantas. Sin embargo, la comprensión de las interacciones tempranas entre las semillas y spp. sigue siendo limitada. En el presente trabajo, se utilizaron espectroscopia infrarroja por transformada de Fourier (FTIR) y espectroscopia Raman para revelar la naturaleza de la germinación de semillas de tomate estimulada por . Se observó una respuesta rápida de las semillas de tomate a spp. dentro de las 48 horas en un sustrato de medio de Murashige y Skoog (MS), precediendo cualquier contacto físico. El análisis Raman indicó que ambas especies estimularon la síntesis de compuestos fenólicos al desencadenar respuestas específicas de la planta en las radículas de las semillas. El impacto de y en dos cultivares de tomate resultó en alteraciones de la pectina de la lámina media, celulosa y xiloglucano en la pared celular primaria. Los espectros Raman indicaron un aumento en el contenido de xilan en NA con el tratamiento T9, así como un aumento en las hemicelulosas en GZ con el tratamiento T4. Además, el tratamiento T4 resultó en un aumento de aldehídos conjugados en la lignina en GZ, mientras que la tendencia se invirtió en NA. Adicionalmente, el análisis FTIR reveló cambios significativos en los niveles totales de proteínas en las radículas de semillas de tomate tratadas con spp., con disminuciones simultáneas en pectina y/o xiloglucano. Nuestros resultados indican que dos métodos espectroscópicos complementarios, FTIR y espectroscopia Raman, pueden proporcionar información valiosa sobre los cambios rápidos en la estructura de la pared celular de las radículas de tomate durante la germinación estimulada por spp.