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Explotando el perfilado multi-ómico y la biología de sistemas para investigar las funciones de TOMM34

Autores: Poverennaya, Ekaterina V.; Pyatnitskiy, Mikhail A.; Dolgalev, Georgii V.; Arzumanian, Viktoria A.; Kiseleva, Olga I.; Kurbatov, Ilya Yu.; Kurbatov, Leonid K.; Vakhrushev, Igor V.; Romashin, Daniil D.; Kim, Yan S.; Ponomarenko, Elena A.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Explotando el perfilado multi-ómico y la biología de sistemas para investigar las funciones de TOMM34


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Biología moderna
Genes asociados a mitocondrias
Métodos de perfilado multi-óptico
Translocasa de la membrana mitocondrial externa
Fosforilación oxidativa
Algoritmo de enriquecimiento de red de novo

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 14

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Aunque la biología moderna se encuentra ahora en la era post-genómica con un acceso enormemente aumentado a datos de alta calidad, el conjunto de genes humanos con una función conocida sigue estando lejos de ser completo. Esto es especialmente cierto para cientos de genes asociados a mitocondrias, que están poco caracterizados y carecen de una clara anotación funcional. Sin embargo, con la llegada de métodos de perfilado multi-óptico junto con algoritmos de biología de sistemas, se puede elucidar el papel celular de muchos de estos genes. Aquí, informamos sobre genes y vías asociadas con el Translocasa de la Membrana Mitocondrial Externa, que juega un papel en la importación de proteínas mitocondriales como parte de un complejo citosólico junto con Hsp70/Hsp90 y está regulado al alza en varios cánceres. Identificamos genes, proteínas y metabolitos alterados en células HepG2. Hasta donde sabemos, este es el primer intento de estudiar la capacidad funcional utilizando una estrategia multi-óptica. Demostramos que afecta varios procesos, incluyendo la fosforilación oxidativa, el ciclo del ácido cítrico, el metabolismo de purinas y varios aminoácidos. Además del análisis de vías ya conocidas, utilizamos un algoritmo de enriquecimiento de red de novo para extraer subredes perturbadas novedosas, obteniendo así evidencia de que potencialmente juega un papel en varios otros procesos celulares, incluyendo la señalización NOTCH, MAPK y STAT3. En conjunto, nuestros hallazgos proporcionan nuevas perspectivas sobre las funciones celulares de .

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