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Investigación a Nivel de Pan-Genoma y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en Maíz

Autores: Zhao, Fangfang; Li, Xia; Chen, Ziqi; Guo, Changhong

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Investigación a Nivel de Pan-Genoma y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en Maíz


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Factor de transcripción
Maíz
Genes
Relación Ka/Ks
Estrés abiótico
Niveles de expresión

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 11

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
GATA es un factor de transcripción crucial involucrado en el crecimiento, desarrollo y respuestas de las plantas al estrés abiótico. Por lo tanto, identificar y explorar los factores de transcripción GATA en el maíz es de gran importancia. En este estudio, identificamos 75 genes basados en el pan-genoma del maíz, que incluye 26 genomas de maíz de alta calidad. Estos consisten en 58 genes centrales (presentes en todas las 26 líneas), 12 genes no esenciales (presentes en 2 a 23 líneas), 2 genes casi centrales (presentes en 24 a 25 líneas) y 3 genes privados (presentes en solo 1 línea). Al evaluar la relación Ka/Ks de los genes en 26 variedades de maíz, encontramos que las relaciones Ka/Ks de , , , y eran mayores que 1, lo que puede indicar que estos cuatro genes están bajo selección positiva. En contraste, las relaciones Ka/Ks de otros genes eran menores que 1, lo que sugiere que estos genes pueden estar bajo selección purificadora. En los 26 genomas de maíz, observamos una diferencia significativa en la expresión de entre variedades afectadas por variaciones estructurales (SVs) y aquellas no afectadas. En ciertas variedades, las SVs alteraron estructuras conservadas. Además, analizamos los niveles de expresión de genes en diferentes tejidos de maíz y bajo estrés abiótico. y se expresaron altamente en el endospermo, influyendo así en la síntesis de almidón, mientras que , , , , y se encontraron asociados con respuestas al estrés abiótico. Estos hallazgos proporcionan nuevos recursos valiosos para la investigación funcional sobre .

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