Las introducciones generalizadas de especies no nativas, incluidas las especies de acuicultura y ornamentales, amenazan la biodiversidad y el funcionamiento de los ecosistemas al modificar la estructura trófica de las comunidades. En este estudio, cuantificamos las múltiples facetas de la disrupción trófica en comunidades de agua dulce invadidas por tilapia del Nilo, comparando ríos no invadidos e invadidos río abajo del río Perla, en China. La invasión de la tilapia del Nilo redujo el estatus trófico de las especies de peces nativos al obligar a los herbívoros y planctívoros nativos a buscar nuevas fuentes de alimento. La cadena alimentaria también se acortó al disminuir los niveles tróficos de los invertívoros, omnívoros y piscívoros nativos, mientras que el área total del nicho isotópico (TA) de las especies de invertívoros, omnívoros, piscívoros y planctívoros nativos también disminuyó. Al mismo tiempo, la invasión de la tilapia del Nilo afectó la diversidad isotópica de la comunidad de peces. La disminución de la riqueza isotópica (IRic), la uniformidad isotópica (IEve) y el aumento de la singularidad isotópica (IUni) indicaron que la tilapia del Nilo tenía una alta superposición del nicho trófico con las especies nativas y competía con las especies nativas por los recursos alimentarios, e incluso causó la compresión del nicho trófico de las especies nativas. Comprender el proceso descrito en este estudio es esencial para conservar la estabilidad de los ecosistemas de agua dulce y mejorar la estrategia de control de organismos acuáticos alienígenas en el sur de China.