Los lirios son flores bien conocidas con grandes anteras y una alta cantidad de polen que contamina fácilmente la ropa y los tépalos. Las anteras necesitan ser eliminadas artificialmente, lo que lleva a problemas de producción. Cultivar lirios estériles masculinos o libres de polen podría resolver estos problemas. El período clave de esterilidad masculina en una población específica de lirios híbridos estériles masculinos se determinó a través de observaciones citológicas. Los contenidos de hormonas, azúcar soluble, proteína soluble y prolina se determinaron mediante cromatografía líquida de alta resolución, espectrometría de masas en tándem y colorimetría. La secuenciación del transcriptoma se utilizó para identificar los genes con expresión alterada. Se determinó que el período clave de esterilidad masculina era en las etapas de madre de microsporas y tétra. Los contenidos hormonales eran anormales en la línea estéril en comparación con la línea fértil. El contenido de ácido indol-3-acético (IAA) fue mayor en la línea estéril que en la línea fértil en todas las etapas, mientras que el contenido de ácido giberélico 4 (GA4) mostró el resultado opuesto. El ácido abscísico (ABA) se acumuló en la línea estéril tanto en las etapas de madre de microsporas como en la de tétra, y el contenido de ribósido de zeatina (ZR) en la línea estéril aumentó en la etapa de madre de microsporas pero disminuyó en la etapa de tétra. Los contenidos de azúcar soluble, proteína soluble y prolina fueron más altos en la línea fértil que en la línea estéril. Los genes involucrados en la síntesis de auxina y ABA y en las vías de señalización se expresaron en alta cantidad en la línea estéril masculina. Nuestros datos sugieren que los contenidos anormales de hormonas en las etapas de madre de microsporas y tétra resultaron en aborto de polen en una población de lirios híbridos estériles masculinos, lo que indica que el equilibrio hormonal en etapas específicas desempeña funciones críticas en el desarrollo del polen en los lirios.