La microbiota endofítica juega un papel no solo en suministrar a las plantas los nutrientes básicos indispensables para su crecimiento, sino que también les ayuda en los mecanismos de adaptación a diversos estreses ambientales (es decir, salinidad, sequía), lo cual es importante en el aspecto de los rendimientos de los cultivos. Desde los puntos de vista agrícola y biotecnológico, el conocimiento de los endófitos y sus roles en el aumento de los rendimientos de los cultivos, la resistencia de las plantas a las enfermedades y la ayuda para sobrevivir al estrés ambiental es extremadamente deseable. Este artículo revisa algunas de las interacciones planta-microorganismo beneficiosas que podrían ser potencialmente utilizadas tanto en la agricultura (efecto de estimulación del crecimiento de las plantas, adaptación de los organismos huéspedes a condiciones de salinidad y sequía, y apoyo de los mecanismos de defensa en las plantas), como en la biotecnología (metabolitos bioactivos, aplicación de endófitos para procesos de biorremediación y biotransformación, y producción de biofertilizantes y biopreparados). Es importante destacar que en este artículo se resumen informes relativamente recientes sobre endófitos de los últimos 10 años.