La tolerancia a la sal es un rasgo importante en el cultivo y mejoramiento de la soja. Las respuestas de las plantas al estrés salino incluyen cambios fisiológicos y bioquímicos que afectan el movimiento del agua a través de la membrana plasmática. Las proteínas intrínsecas de la membrana plasmática (PIPs) se localizan en la membrana plasmática y regulan el flujo de agua y solutos. En este estudio, se emplearon PCR cuantitativa en tiempo real y hibridación de levaduras para analizar los perfiles de expresión génica temprana e interacciones de un conjunto de PIPs de soja en respuesta al estrés salino. Un total de 20 genes codificadores de PIPs mostraron perfiles de expresión variados después del estrés salino. Entre ellos, 13 genes exhibieron un patrón de expresión disminuido, incluido PIP1;6, cuya sobreexpresión constitutiva podría mejorar la tolerancia a la sal de la soja, y sus homólogos cercanos PIP1;7 y 1;5. Tres genes mostraron patrones de expresión aumentados, incluido el homólogo cercano PIP1;4 de PIP1;6, mientras que cuatro genes mostraron patrones de expresión aumentados y luego disminuidos. PIP1;5 y PIP1;6 podrían interactuar físicamente de manera fuerte con PIP2;2, PIP2;4, PIP2;6, PIP2;8, PIP2;9, PIP2;11 y PIP2;13. Se detectaron interacciones definitivas entre PIP1;6 y PIP1;7, y PIP2;9 realizó una homo-interacción. Las interacciones de PIP1;5 con PIP2;11 y 2;13, PIP1;6 con PIP2;9, 2;11 y PIP2;13, y PIP2;9 consigo mismo se fortalecieron en respuesta al estrés salino en lugar del estrés osmótico. En conjunto, inferimos que los tipos PIP1 y PIP2 podrían asociarse entre sí para funcionar sinérgicamente en la célula vegetal; un ambiente de estrés salino podría promover parte de sus interacciones. Este resultado proporcionó nuevas pistas para comprender mejor las interacciones de las isoformas de PIP de la soja, que conducen a potencialmente funcional homo- y heterotetrámeros para la tolerancia a la sal.