Los dinoflagelados y las bacterias heterótrofas son dos grupos principales de microorganismos dentro de los ecosistemas marinos. Su coexistencia ha llevado a una relación coevolutiva caracterizada por interacciones intrincadas que no solo alteran sus comportamientos individuales, sino que también ejercen una influencia significativa en los ciclos biogeoquímicos más amplios. Nuestra revisión comenzó con un análisis de las poblaciones bacterianas, tanto libres como adheridas a las superficies de los dinoflagelados. Se ha encontrado que miembros de Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria y el grupo Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides están repetidamente asociados con dinoflagelados, representados por relativamente pocos géneros, como , , y . Estos taxones bacterianos interactúan con los dinoflagelados en una capacidad limitada, involucrando el intercambio de nutrientes, la secreción de sustancias patógenas o la participación en la producción química. Además, la evolución genómica de los dinoflagelados ha sido profundamente impactada por la transferencia horizontal de genes de las bacterias. La integración de genes bacterianos en los dinoflagelados ha sido fundamental para definir sus características biológicas y estrategias nutricionales. Esta revisión tiene como objetivo elucidar las interacciones matizadas entre los dinoflagelados y sus bacterias asociadas, ofreciendo una perspectiva detallada sobre su compleja relación.