El enfoque ágil y las herramientas son populares para la gestión del desarrollo de Software de Aplicaciones Empresariales (EAS). Este artículo se centra en el problema de la inconsistencia entre los objetivos estratégicos de negocio y la funcionalidad del software desarrollado. Las herramientas de gestión ágil carecen de la funcionalidad de coordinación de actividades del proyecto EAS. Este artículo tiene como objetivo repensar la gestión de proyectos ágiles utilizando el enfoque de modelado causal. Se desarrolló un modelo causal de gestión de proyectos ágiles utilizando un concepto de transacción de gestión (MT). Se utilizó la noción del espacio de procesos para identificar la ubicación de los MT a lo largo de los ejes de agregación, generalización y tiempo, y formalizar sus especificaciones de interacción. Se desarrolló una taxonomía de los meta-tipos y tipos de coordinación utilizando los identificadores de los MT. Se desarrolló la jerarquía de actividades ágiles modificada, y se identificaron las interacciones causales verticales y horizontales entre las actividades ágiles. Este modelo de gestión ágil modificado ayuda a seguir de manera consistente la integridad del contenido del proyecto EAS. Se introdujeron indicadores de complejidad para evaluar la complejidad del proyecto EAS y se presentan sus valores promedio y normalizados. Se proponen atributos adicionales en la herramienta de gestión ágil Jira. Monitorear la discrepancia entre los objetivos estratégicos de negocio y el contenido de las actividades de desarrollo ayuda a mejorar el éxito en la entrega de proyectos EAS.