Los hongos entomopatógenos, a menudo reconocidos principalmente por sus propiedades insecticidas, cumplen diversas funciones dentro de los ecosistemas. Estos roles abarcan el endofitismo, la antagonismo contra enfermedades de las plantas, la promoción del crecimiento de las plantas y la inhabitación de la rizosfera, ocurriendo tanto de manera natural como tras inoculación artificial, como lo respalda un creciente cuerpo de investigaciones contemporáneas. Numerosos estudios han destacado los aspectos beneficiosos de la colonización endofítica. Esta revisión tiene como objetivo organizar sistemáticamente la información sobre las implicaciones directas (adquisición de nutrientes y producción de fitohormonas) e indirectas (inducción de resistencia, producción de antibióticos y metabolitos secundarios, producción de sideróforos y mitigación de estrés abiótico y biótico) de la colonización endofítica. Además, se proporciona una discusión exhaustiva de estos mecanismos. Se han reconocido varios desafíos, incluyendo las complejidades de aislamiento, la clasificación de nuevas cepas y el impacto de la ubicación terrestre, el tipo de vegetación y la renuencia antropogénica a utilizar entomopatógenos fúngicos, como obstáculos. Sin embargo, los recientes avances en biotecnología dentro de la investigación microbiana ofrecen soluciones prometedoras a muchos de estos desafíos. En última instancia, las limitaciones actuales delinean posibles avenidas futuras para aprovechar los entomopatógenos fúngicos endofíticos como agentes de control microbiano duales.