El intercultivo es un método eficiente para mejorar la utilización de nutrientes. Sin embargo, se necesita estudiar más el impacto del intercultivo intraespecífico en el ciclo microbiano del nitrógeno en la rizosfera. En este estudio, se seleccionaron dos cultivares de maíz como materiales: Zhengdan958 (ZD958, alta eficiencia en el uso del nitrógeno) y Denghai3622 (DH3622, baja eficiencia en el uso del nitrógeno). Se establecieron tres patrones de siembra (intercultivo, monocultivo de ZD958 y monocultivo de DH3622) para estudiar los efectos del intercultivo en el crecimiento del cultivo y la función del ciclo microbiano del nitrógeno en la rizosfera bajo dos niveles de nitrógeno: bajo nitrógeno (140 kg N ha) y nitrógeno normal (280 kg N ha). Los resultados mostraron que el rendimiento de grano y el contenido de nitrógeno en el intercultivo aumentaron significativamente debido a un índice de área foliar y peso seco de raíces mejorados. La acumulación de nitrógeno y la eficiencia en el uso del nitrógeno se mejoraron en un 8,14% y un 19,38% en el intercultivo, lo que resultó en reducciones en el contenido de NH y NO en la rizosfera. El intercultivo mejoró los procesos de ciclo del nitrógeno en la rizosfera; la nitrificación, la desnitrificación y la reducción de nitrato aumentaron. Este estudio demostró que el intercultivo promueve la adquisición de nitrógeno del suelo por parte del maíz y regula indirectamente la función microbiana de la rizosfera. Estos hallazgos implican que el intercultivo intraespecífico de cultivos con rasgos funcionales apropiados es un enfoque prometedor para establecer ecosistemas de utilización de recursos diversificados, productivos y eficientes.